据台湾媒体报道，M503航线距离台湾海峡中线仅有7.8公里，台方担忧，该航线开启后恐危及台湾往返金门、马祖的飞航安全，台湾空防更可能受到冲击。但据中国大陆民航局表示，该航线为民航航线，大陆空管部门与台湾方面会保持技术性沟通。

宋晓梧：看侧重什么了。当前的重点应该是结构调整，增速低一点我觉得关系不大。结构调整是为中长期的经济增长打基础，如果着眼于十年、二十年或更长远的经济发展，经济增速和结构调整是一致的。

《天气预报员这样炼成:见识各种天气 经历风霜雨雪》对此，中国外交部5日独家回应《环球时报》记者相关问询称，已注意到相关报道，“关于M503北上航线启用问题，国台办和民航局已做了详细说明，希望美方客观看待。”外交部还表示，在台湾问题上，希望美方恪守一个中国政策和中美三个联合公报原则，妥善处理有关问题。